Atribuindo integralmente o Berghoff Beer Blog a esta interessante história (mina de ênfase),
Em torno da Segunda Guerra Mundial, o vidro castanho subiu na procura e muitas empresas tiveram de renunciar ao seu vidro castanho para o seu país. Infelizmente isso significou que as empresas com cervejas de maior qualidade tiveram de usar vidro transparente, o que fez com que as suas cervejas parecessem cervejas mais baratas e claras. A solução dos fabricantes de cerveja de melhor qualidade foi vender a sua cerveja em garrafas verdes para que o consumidor pudesse distinguir entre uma cerveja normal e uma cerveja de melhor qualidade. A garrafa de cerveja verde tornou-se um símbolo de status para muitas cervejeiras europeias.
Hoje em dia, não há muita razão para vender uma cerveja numa garrafa verde a não ser para marketing e estética. Muitas empresas utilizam-na para distinguir a sua cerveja das outras. Claro que algumas cervejas usam garrafas verdes há tanto tempo, que agora parece uma tolice mudar para um copo castanho.
Sorte a nossa, os fornecedores de vidro são capazes de aplicar revestimentos transparentes, protegidos contra os raios UV, ao vidro que ajudam a manter a cerveja fresca, independentemente do tipo de garrafa em que esteja. […]
http://www.berghoffbeer. com/blog/what-does-the-color-of-your-beer-bottle-mean/
Assim, talvez já não seja o caso de as garrafas transparentes e verdes serem (visivelmente) inferiores às garrafas castanhas!
Edit: Não encontrei fontes históricas para as alegações acima referidas, mesmo algumas indicações de uma maior procura de vidro castanho durante a Segunda Guerra Mundial. No entanto, a história parece hoje amplamente acreditada, verdadeira ou não.